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DAY 15
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AI & Data

生資的路且重且遠,我要被鴨垮了Q系列 第 15

Day15. Biobanks & Data Sharing--2

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Biobank

  1. Varsome

    • Varsome是一個基因組變異分析平台,用於解釋基因組中的變異。
    • 它整合了多個數據源,包括Ensembl、gnomAD和ClinVar等,以提供基因組變異的評估和注釋。
    • Varsome可用於臨床遺傳學和研究領域。
      (QAQ 他好用的API要錢...)
      https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20230926/20133400KusOC6olwd.png
  2. dbSNP(Single Nucleotide Polymorphism database):

    • dbSNP是一個公共的核酸多態性數據庫,收集了單核苷酸多態性(SNP)的信息。
    • 它包含了不同物種的SNP數據,並提供了SNP的注釋、位置和頻率等信息。
    • dbSNP的數據可用於基因組學研究和遺傳學研究。

https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20230926/20133400uTurPYdSmJ.png

額外介紹 Taiwan Biobank
簡單來說就是台灣人的Biobank,收集台灣人的資料。

https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20230926/20133400eC2ql195hc.png

https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20230926/20133400dLLdOvY9l7.png

另外,注意唷,有些 Biobamk 的資料是要錢的唷~~ !
你要花錢買sample 的 DNA 或是花錢買這些 Biobamk release 的 data 做研究,做研就要錢阿。

為什麼數據共享重要?

簡要羅列一些重點,但也許有更多的點可以說~~~

  1. 促進科學研究進展:數據共享可以促進更多的科學家和研究機構參與研究,加速科學進步。
  2. 提高數據質量:多個研究機構共享數據可以通過不同的角度和方法進行驗證,提高數據的質量和可信度。
  3. 更好地理解疾病:共享臨床數據和生物樣本可以幫助科學家更好地理解疾病的發病機制,促進醫學進步。

當前的數據共享狀況

  • 部分生物庫和研究計劃已經開始實行數據共享,但還存在挑戰,如隱私保護、安全性和道德問題。
  • 一些國際合作項目,如全球基因體聯盟(Global Alliance for Genomics and Health)致力於制定數據共享的標準和指南。

如何分享數據?

  • 通過建立數據共享平台,研究機構可以將數據和相關信息存儲在一個可訪問的數據庫中。
  • 遵循隱私保護和倫理準則,對數據進行匿名化處理,以保護參與者的隱私。
  • 制定共享協議,明確規定數據的使用和共享條件。

應考慮的問題

  • 隱私和安全性:確保數據共享不會侵犯個人隱私,並保護數據的安全性。
  • 道德和倫理問題:處理數據時應考慮參與者的知情同意和利益。
  • 法律法規:遵守當地和國際的數據保護法律和法規。
  • 數據標準:確保數據以一致的格式和標準共享,以便更廣泛的使用。

這只是一個簡要的概述,太多的網站跟DB了~~~


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